有人提出疑问，在土地出让金不变的情况下开征房产税，是不是重复征税？产生这种怨言的原因在于没有分清土地出让金和房产税的区别。
如果把房产税和土地出让金混在一起，势必出现混乱。目前，商品房的房价中有相当大的一块是土地出让金。每年征收的房产税数额会随着不动产市值或租金而变化，而土地出让金只发生在不动产交易中。毫无疑问，当前所有的购房者都已经交了土地出让金。如果把房产税和土地出让金混淆在一起，要求已经交了土地出让金的业主再交房产税，确实是重复征税。有人主张对已交土地出让金的业主免除若干年的房产税，或者按照较低的税率征收。可是，无论是免还是减，都缺乏合理的计算依据。由于没有一个确定的边界，不管怎么算，都会有人喊不公平。
在征收房产税的时候，土地归土地，房产归房产。桥是桥，路是路，必须把事情的脉络理清楚。土地出让金仅仅发生在土地批租环节。开发商通过招拍挂取得土地使用权，支付土地出让金。当然，他们支付的土地出让金会作为成本转嫁给购房者。实际上，购房者支付的房价中有一部分就是地价。购房是一次性发生的，在随后漫长的岁月中，国家机器对业主提供产权保护和各种必要的服务。业主享受了这些服务，自然需要支付费用，这个费用就叫作“房产税”。
住房和城乡建设部（以下简称“住建部”）研究中心的陈淮研究员也认为，那种“不能追征”的说法是把交易环节的税赋和持有环节的税赋混为一谈了。[注释]
实际上，世界上有不少国家和地区就是这样分别处理的，这在实践上和理论上都是站得住脚的。
[1]陈淮，“房产价格不是最核心的，税收才是最核心”，2005年6月21日。
